Jeskyně Balcarka - ochrana a výzkum

V roce 1956 byl Moravský kras vyhlášen chráněnou krajinnou oblastí. Všechny podzemní i povrchové krasové jevy, jejich živé i neživé součásti, jsou přísně chráněny podle zákona č.114/92 Sb., o ochraně přírody a krajiny. Od roku 1991 jsou jeskyně ve správě a přímé péči odborné organizace státní ochrany přírody. Podle přísného provozního režimu, limitujícího počty a frekvenci návštěvníků slouží jeskyně Balcarka veřejnosti i odborným exkurzím. Podzemní prostory Balcarky jsou významným zimovištěm několika chráněných druhů netopýrů.
V jeskyni se provádějí mikroklimatická měření, která slouží k hlubšímu poznání krasových procesů. Speleologický výzkum v systému Balcarky v posledních desetiletích ustal. Amatérští jeskyňáři však provádějí intenzívní průzkum okolních lokalit, jakými jsou Lopač či Vintoky. Jejich snahou je proniknout do prostor vytvořených Ostrovskými vodami, které vyvěrají v Malým výtoku v Pustém žlebu. Právě v ponorném systému Lopače, který se kdysi svou výmolnou činností podílel na vzniku Balcarky, se podařilo objevit stovky metrů nových chodeb a dómů. Průzkumy dále pokračují.